雖然我國的電子商務經過十年的飛速發展，但目前國內中小企業開展電子商務過程中仍存在著不少問題。主要是：

　　1．競爭意識不強，思想認識模糊。絕大多數企業還把競爭焦點定位于實體市場，沒有充分認識到知識經濟時代搶占網絡信息虛擬市場的必要性和緊迫性。即使已經進行電子商務的中小企業，也并未真正認識電子商務的作用。

　　2．上網企業數量少，分布不均勻。全國560萬家企業（合鄉鎮企業）中、上網企業所占比例不足1．5％，并且集中分布在北京、廣州、上海等幾個大城市。中小企業上網少，瀏覽客戶就少，網絡給企業創造的效益就減緩，從而形成惡性循環。

　　3．企業本身電子商務建設力不從心，且選擇的一些電子商務平臺良莠不齊。大多數中小企業計算機和網絡基礎設施薄弱，沒有自己的相關專業人才，一些中小型企業根本無力自行開發電子商務系統，單純依靠一些專門的電子商務平臺（如實惠網，阿里巴巴等），很難實現企業歷任最大化，所以企業當前的電子商務程度還處在一個高期望低水平的狀態，多數中小企業尚未認識到電子商務能給他們帶來比大企業更為有利的機遇。

　　4．政策法規不夠完善。電子商務是一項復雜的系統工程，它不僅涉及參加交易的雙方，而且涉及不同地區及不同國家的工商管理、海關、保險、稅收、銀行等部門。這就需要有統一的法律和政策框架以及強有力的跨地區、跨部門的綜合協調機構。雖然近年來我國已經出臺了一些有關法規，但總體來看還是很不健全的，尤其是在跨國家、跨地區、跨部門協調方面存在不少問題。（臺灣SEO編選）